Tiga pembalap utama tereliminasi dari kualifikasi Q1 di Spa-Francorchamps, memaksa mereka untuk memulai balapan dari baris belakang. Pembalap Ferrari, Hamilton, terpaksa mendapat hukuman waktu terbaiknya dihapus karena melanggar batas lintasan saat melintasi Raidillon, sehingga turun ke posisi ke-16. Antonelli menemukan dirinya di posisi ke-18 setelah akhir pekan yang mengecewakan di Mercedes, sementara Alonso berhasil lolos kualifikasi di depan rekan setimnya di Aston Martin, Lance Stroll, di P19.
Ketiga pembalap tersebut telah mengalami masalah mesin dan karena masih setengah musim tersisa untuk musim 2025, mereka memutuskan untuk menambahkan komponen power unit baru. Hamilton, Antonelli, dan Alonso menerima mesin baru dengan pembakaran internal kelima, turbocharger, dan unit MGU-H dan MGU-K listrik untuk balapan Minggu, dengan hanya empat unit yang diizinkan untuk musim ini. Selain itu, Hamilton juga mengganti komponen mesin lain di mobil Ferrari-nya, termasuk baterai, kontrol elektronik, dan knalpot baru.
Peserta lainnya, Sainz dari Williams, juga harus memulai balapan dari pitlane setelah melakukan perubahan set-up pada mobilnya dalam kondisi parc ferme. Ini membuat hanya 16 pembalap yang akan memberi start di grid balapan yang diselimuti cuaca tidak menentu setelah hujan deras mengguyur lintasan. Hamilton tidak sepakat dengan keputusan para steward terkait pelanggaran batas lintasan yang dilakukannya, namun ia mengakui kesalahannya dan meminta maaf kepada tim atas kegagalannya di kualifikasi. Meskipun demikian, Hamilton memiliki harapan untuk dapat berbuat lebih baik dalam balapan yang akan datang.
